El chakra es la energia que un ninja necesita para hacer una tecnica. Para esto se juntan dos energias: la energia fisica que existe en toda celula del cuerpo y la energia espiritual que se aumenta con el entrenamiento y la experiencia. Al juntarse estas dos energias se crea lo que es llamado chakra y realizando los correspondientes sellos se puede ejecutar un jutsu.
Hay cinco tipos de jutsus: Fuego, Agua, Viento, Tierra y Relampago. Dependiendo del tipo de jutsu se usara mas cantidad de chakra o menos. El controlar el chakra es muy importante ya que si lo malgastas o usas demasiado podrias poner tu vida en juego ademas de que sea mas o menos efectivo el jutsu ya que, si se usa demasiado chakra en el jutsu, la resistencia caera en picado y si se usa menos de lo normal, el jutsu no sera efectivo. Ademas de esto, el controlarlo tambien es de utilidad como por ejemplo para concentrarlo en la planta de los pies y quedar pegados a un arbol sin usar las manos.
El sistema circulatorio de chakra rodea muchos organos vitales del cuerpo y esta alrededor de los organos que mezclan el chakra por lo que si se ataca afecta a los organos internos. Solo pueden ver el sistema circulatorio de chakra el clan Hyuga pudiendo atacar al tenketsu (puntos de chakra) golpeando en los 361 puntos quedando el afectado sin poder realizar ningun jutsu.
Hablando de esto, tambien es importante mencionar las ocho puertas. En el ya hablado sistema circulatorio de chakra, hay ocho puertas que controlan el flujo del chakra donde son enfocados los 361 puntos de apertura de chakra. Al abrir cualquiera de las puertas, el poder aunmenta considerablemente en el cuerpo del que las abre. La puerta de apertura como su nombre indica, es la primera en abrirse con la tecnica loto secundario. Esta puerta permite usar los musculos hasta el punto mas extremo. La segunda puerta en abrir es la de la energia y se abre con la tecnica loto primario. Con esto la fuerza del ninja aumentara muchisimo y es raro que se intente abrir otra mas ya que cada una que se abre, mas posibilidades de morir se tiene. Lee por ejemplo es capaz de abrir 5 puertas y llegar a tener mas fuerza que un jounin o el mismisimo Hokage quiza.